适用于二代测序技术的细菌DNA提取方法的比较研究

• 作者: 何秋星 刘德星 岳巧云 邱德义 陈佩 陈利伟
• 来源期刊: 检验检疫学刊
• 学科: 医学
• 关键词: 二代测序技术 细菌DNA提取方法 16S rRNA V3-V4高变区
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 研究与探讨
• 页码范围: 55-60,29
• 页数: 7页
• 分类号: R37
• 字数: 6402字
• 语种: 中文

摘要

为建立用于二代测序技术的最适细菌DNA提取方法.分别用磁珠法、热裂解法、试剂盒法(有溶菌酶处理和无溶菌酶处理)、超声波法、超声+热裂解法共6种方法提取等量混合的细菌DNA,特异性扩增其16S rRNA的V3-V4高变区基因,经二代测序并分析结果中的细菌种类及其相对含量分布.6种方法的测序结果中,细菌种类鉴定结果无明显差异;而在磁珠法和试剂盒法(有溶菌酶处理)结果中,不同细菌的含量分布最为接近样品中的真实情况.在6种方法中,磁珠法和试剂盒法(有溶菌酶处理)适合于二代测序技术中混合细菌DNA的提取.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳巧云		37	189	10.0	12.0
2	邱德义		3	1	1.0	1.0
4	陈利伟		3	1	1.0	1.0
6	何秋星		11	9	2.0	2.0
9	陈佩		4	6	1.0	2.0
13	刘德星		11	71	5.0	8.0