基于环介导等温扩增技术快速检测瓜果腐霉菌

• 作者: 于佳 朱也 李庆玲 沈丹宇 窦道龙 赵媛媛
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 瓜果腐霉菌 环介导等温扩增 快速检测 羟基萘酚蓝(HNB)
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 植物科学
• 页码范围: 79-87
• 页数: 9页
• 分类号: Q93-331
• 字数: 5726字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201703025

摘要

[目的]建立一种快速、准确的检测瓜果腐霉菌(Pythium aphanidermatum)的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法,为诊断和防治瓜果腐霉菌引起的植物病害提供技术支撑.[方法]通过比较基因组学方法,在瓜果腐霉菌基因组上筛选有序列特异性的基因作为检测的靶标基因,设计LAMP 特异性引物,建立一种基于颜色判定的快速、准确的LAMP检测方法,随后对该检测方法的特异性、灵敏度和发病组织实际检测等进行分析评价.[结果]鉴定到1个编码Trypsin蛋白酶的基因是瓜果腐霉菌特异的基因,以该序列作为靶标建立了LAMP检测方法.在扩增前加入染料羟基萘酚蓝(HNB)作为指示剂,在等温条件(64℃)下进行核酸扩增反应60 min,即可通过肉眼直接观察结果,HNB显示天蓝色即为阳性反应;同时,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳验证为梯形条带,也可判定为阳性反应.特异性试验中,建立的LAMP检测方法能将瓜果腐霉菌和其他病原菌区分开.灵敏度试验中,LAMP 检测方法的最低检测限为100 pg·μL-1,与Real-time PCR反应灵敏度一样,是普通PCR反应灵敏度的100倍.发病组织实际检测试验中,该LAMP方法能检测出人工接种发病植株中的瓜果腐霉菌.[结论]成功建立了一种适用于基层使用的针对瓜果腐霉菌的快速检测技术,为该菌所致病害的准确诊断奠定了技术基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	于佳	南京农业大学植物保护学院	3	18	2.0	3.0
2	窦道龙	南京农业大学植物保护学院	13	41	4.0	6.0
3	沈丹宇	南京农业大学植物保护学院	5	9	2.0	3.0
4	赵媛媛	南京农业大学植物保护学院	2	7	2.0	2.0
5	李庆玲	南京农业大学植物保护学院	1	5	1.0	1.0
6	朱也	南京农业大学植物保护学院	1	5	1.0	1.0