烟草半胱氨酸蛋白酶的基因和蛋白序列分析

• 作者: 刘彪 杨柳 殷雪艳 王光云 罗万麟 赵爽
• 来源期刊: 天津农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 半胱氨酸蛋白酶 基因序列 蛋白序列
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 植物生理与生物技术
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: S572
• 字数: 1529字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-6500.2018.09.001

摘要

以ABW71226.1、BAA96501.1、ACB70409.1、AAW78660.1和ADV41672.1为材料,采用生物数据分析工具对烟草的半胱氨酸蛋白酶的基因和蛋白序列进行分析,分别以GSDS、MEME和SignalP 4.1工具对其基因结构、保守基序和信号肽进行检测.结果显示,NtCP-1和NtCP-2基因具有7个外显子,NtCP-3和NtCP-4基因含有4个外显子,NtCP-5基因具有3个外显子,NtCP-1、NtCP-2和NtCP-5基因具有上游序列,NtCP-1、NtCP-2、NtCP-4和NtCP-5基因具有下游序列;检测NtCP共有5个Motif,其核心保守基序区为Motif-1-Motif-2-Motif-4,且位于木瓜蛋白酶家族半胱氨酸蛋白酶结构域中,Motif-1和Motif-2含有半胱氨酸和谷氨酰胺;NtCP均属于信号肽,NtCP-1和NtCP-2的信号区分布相同(1～22),NtCP-3和NtCP-4的信号区分布相同(1 ～20),NtCP-5的信号区为1～ 29.