芒果精氨酸脱羧酶基因MiADC的克隆及表达分析

• 作者: 刘荣 范建新 韩树全 黄海
• 来源期刊: 农业科学与技术（英文版）
• 关键词: 芒果 MiADCgene RACE 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 9-16
• 页数: 8页
• 字数: 829字
• 语种: 英文

摘要

精氨酸脱羧酶(Arginine decarboxylase,ADC)在植物多胺生物合成中发挥着重要作用.为了研究精氨酸脱羧酶基因(ADC)在芒果中的结构与表达情况,试验采用RACE技术从芒果嫩叶中克隆获得芒果精氨酸脱羧酶基因MiADC,并以MiADC基因的cDNA序列为基础,采用qRT-PCR分析该基因的表达情况.序列分析结果显示:芒果MiADC基因全长3089 bp,包括575 bp 5'-UTR,2178 bp ORF,311 bp 3'-UTR和25 bp poly(A),且无内含子.NCBI比对分析显示:该基因与枳(Poncirus trifoliate)精氨酸脱羧酶基因(HQ008237.1)的相似性最高,为78％;其预测蛋白同样与枳(Poncirus trifoliate)精氨酸脱羧酶(AEE99192.1)的相似性最高,为78％.系统发生树分析表明:芒果MiADC与枳(Poncirus trifoliate)的精氨酸脱羧酶处于同一进化枝上.表达分析显示:MiADC基因在根、茎、叶、花、幼果、成熟果组织中均有表达,且该基因的转录水平受低温处理的影响.因此,芒果MiADC基因可能是一个低温胁迫应答基因.