镉胁迫下菜心的转录组分析

• 作者: 刘帅 刘阳 唐玉林 张尉欣
• 来源期刊: 深圳大学学报（理工版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物遗传学 生物信息学 高通量测序 转录组 镉胁迫 菜心
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 543-550
• 页数: 8页
• 分类号: Q943.2|Q786
• 字数: 4594字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1249.2018.05543

摘要

为研究菜心吸收和转运镉的机制,对镉胁迫前后菜心叶部和根部的转录组进行高通量测序及差异表达分析,共获得3 854个差异表达基因.GO (gene ontology)富集分析显示,差异表达基因主要富集在与次生代谢物合成、氧化还原反应、光合作用、铁离子稳态及木质素或木栓质的合成及代谢等有关的GO条目中.KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析结果表明,差异表达上调基因主要富集在植物病原菌互作、植物信号传导、木栓质等物质的生物合成和谷胱甘肽代谢等通路中;差异表达下调基因主要富集在光合作用、核糖体、生物素代谢、脂肪酸的生物合成和芥子油苷的生物合成等通路中;这些差异表达基因可能与菜心应对镉胁迫的生理生化反应相关.分析了菜心在镉胁迫下响应的主要通路及基因,为进一步探索菜心镉胁迫响应机制、培养低镉积累的菜心品种提供理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘帅	深圳大学生命与海洋科学学院广东省植物表观遗传学重点实验室	3	7	2.0	2.0
2	唐玉林	深圳大学生命与海洋科学学院广东省植物表观遗传学重点实验室	10	32	4.0	5.0
6	刘阳	深圳大学生命与海洋科学学院广东省植物表观遗传学重点实验室	22	88	6.0	8.0
7	张尉欣	深圳大学生命与海洋科学学院广东省植物表观遗传学重点实验室	1	0	0.0	0.0