镉胁迫下西瓜的转录组测序分析

• 作者: 孙小武 孙波 李涵 王志伟 邹甜
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 西瓜 镉胁迫 转录组 差异基因 高通量测序
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 园艺学·林学
• 页码范围: 506-513
• 页数: 8页
• 分类号: S651.01
• 字数: 4228字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2018.05.010

摘要

以西瓜品种和欣(HX)和黑媚娘(HMN)的幼苗叶片为材料,经60 mg/kg氯化镉溶液处理(以未经氯化镉溶液处理的为对照)后,采用Illumina测序技术对转录组进行高通量测序,探讨西瓜镉胁迫的分子机理.结果表明:在黑媚娘处理组(HMN)和对照组(HMNCK)中共检测到8579条差异基因,其中有4297条基因表达显著上调,4282条基因表达明显下调;在和欣处理组(HX)和对照组(HXCK)中共检测到7108条差异基因,其中有3662条基因表达显著上调,3446条基因表达显著下调;不同组间差异基因的维恩图表明,HMN和HX组间有5656条差异基因;根据不同数据库的注释信息,发现西瓜体内与镉胁迫相关的差异表达基因主要包括响应光合作用、信号转导、次生物质代谢、转录因子等相关基因;转录因子MYB、AP2/EREBP、bHLH、NAC和WRKY家族可能在西瓜响应镉胁迫中具有重要作用.用qRT-PCR技术对随机挑选的7条基因进行荧光定量验证,结果与Illumina测序数据一致,证实了差异表达基因数据的有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙小武	湖南农业大学园艺园林学院	70	351	12.0	15.0
2	李涵	湖南农业大学园艺园林学院	16	78	5.0	8.0
6	王志伟	湖南农业大学园艺园林学院	17	56	4.0	6.0
10	孙波	湖南农业大学园艺园林学院	9	21	3.0	4.0
11	邹甜	湖南农业大学园艺园林学院	17	47	3.0	6.0