松茸子实体转录组测序及解析

• 作者: 徐漪沙 李翔 温雪菲 王金秋 田琳 耿放 邹萍萍
• 来源期刊: 成都大学学报（自然科学版）
• 关键词: 松茸 转录组 基因功能注释 采后生理 保鲜技术
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 药学与生物工程
• 页码范围: 148-153
• 页数: 6页
• 分类号: R285.5|S646.1+5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-5422.2020.02.007

摘要

以人工种植的商品松茸子实体为对象,利用Illumina Novaseq 6000测序平台对松茸子实体进行转录组测序,并通过生物信息学手段对松茸转录组进行注释和分析.基于9个松茸样品的测序共获得76.38 Gb的数据量,组装得到的转录本和unigene个数分别为26285和87174.将获得的unigene与6大功能数据库进行比对,共有19964个unigene得到注释.基于GO和KEGG数据库的注释和分析,松茸子实体unigene被注释和划分为45个和28个功能类别.在松茸子实体中,涉及unigene数量最多的生理过程包括碳水化合物代谢、运输和分解代谢、氨基酸代谢等.结果表明,松茸子实体中代谢旺盛,应采取合理措施以延缓其品质下降.松茸子实体的转录组测序将为其功能基因的挖掘以及采后品质变化机制的研究提供重要遗传数据和参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王金秋	成都大学药学与生物工程学院	16	24	3.0	4.0
2	耿放	成都大学药学与生物工程学院	10	20	3.0	3.0
3	李翔	成都大学药学与生物工程学院	45	209	7.0	13.0
4	邹萍萍	成都大学药学与生物工程学院	2	0	0.0	0.0
5	田琳	成都大学药学与生物工程学院	2	0	0.0	0.0
6	温雪菲	成都大学药学与生物工程学院	1	0	0.0	0.0
7	徐漪沙	成都大学药学与生物工程学院	1	0	0.0	0.0