凡纳滨对虾繁殖性状的SNP分子标记筛选的初步研究

• 作者: 刘红 王冉
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 卵黄蛋白原基因 SNP 繁殖性状 分子标记
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 825-832
• 页数: 8页
• 分类号: S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.12024/jsou.20180402287

摘要

对虾繁殖性状的相关分子遗传标记一直是甲壳动物中研究极少的部分,为了筛选与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)繁殖性状(产卵与产卵量)相关的SNP(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)分子标记,为凡纳滨对虾的良种选育提供参考,选择卵黄蛋白原(vitellogenin,VG)基因作为筛选基因.本实验采用PCR产物直接测序法对VG基因进行SNP位点筛查,并与繁殖性状进行关联分析.结果表明:(1)在150个凡纳滨对虾样品中,VG基因的4个结构域一共可以检测到37个SNP位点,8个能引起蛋白质氨基酸的同义突变,3个错义突变,26个无义突变.(2)对37个位点进行分析,发现4个可能的SNP候选位点.(3)多态性分析结果显示,4个候选位点都在中等多态水平,多态信息较为丰富.(4)对4个候选位点与产卵次数、产卵总量、平均产卵量和单位体质量产卵量繁殖性状进行单因素方差分析,结果显示位点3839与总产卵量和单位体质量产卵量存在显著性差异(P＜0.05),其他位点不存在显著差异(P＞0.05).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王冉	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	4	7	1.0	2.0
5	刘红	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	33	142	7.0	9.0