线粒体COI基因条形码在鲿科鱼类物种鉴定中的应用

• 作者: 孟彦 李忠 梁宏伟 罗相忠 邹桂伟
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鲿科 DNA条形码 COI基因 物种鉴定 系统发育
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 772-782
• 页数: 11页
• 分类号: S917
• 字数: 7092字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2018.18036

摘要

为了探讨线粒体COI基因作为DNA条形码在中国鲿科(Bagridae)鱼类物种鉴定中的有效性,以及系统发育中的适用性,本研究对4属11种鲿科鱼类进行PCR扩增,获得48条线粒体COI基因序列,同时从GenBank筛选获得8种鲿科鱼类的12条COI基因序列进行分析.19种鲿科鱼类的COI基因序列特征显示:长度为674 bp的COI序列片段平均碱基组成为24.82％A,30.44％T,27.10％C和17.64％G,碱基组成呈现明显的AT偏倚性(55.26％),具有硬骨鱼类的线粒体COI基因的碱基组成的典型特征.核苷酸位点中有变异位点226个,简约信息位点195个,单一信息位点31个,转换颠换比为3.35.19种鲿科鱼类的种内、种间和属间平均遗传距离分别为0.0041、0.1136和0.1268,种间遗传距离平均为种内遗传距离的27.7倍.在本研究中,鲿科鱼类所有的物种均形成单系,在物种鉴别上与形态学分类结果基本一致,然而鲿科的4个属中只有鱯属形成单系,黄颡鱼属、 属和拟鲿属均未形成单系,其进化地位需要进一步研究.线粒体COI基因作为条形码可有效对鲿科鱼类进行物种鉴定,也为鲿科的系统发育提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹桂伟	中国水产科学研究院长江水产研究所	48	499	11.0	21.0
2	孟彦	中国水产科学研究院长江水产研究所	23	306	10.0	17.0
3	李忠	中国水产科学研究院长江水产研究所	20	89	7.0	8.0
4	梁宏伟	中国水产科学研究院长江水产研究所	25	88	7.0	8.0
6	罗相忠	中国水产科学研究院长江水产研究所	23	169	7.0	12.0