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不同花期'西伯利亚'百合花瓣单萜合成途径转录组分析
不同花期'西伯利亚'百合花瓣单萜合成途径转录组分析
作者:
冷平生
唐彪
胡增辉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
'西伯利亚'百合
花香
单萜
转录组测序
差异表达基因分析
摘要:
以'西伯利亚'百合(Lilium'Siberia')花蕾期、半开期、盛开期、衰败期的花瓣为材料,利用RNA-seq技术对其转录组进行高通量测序,分析单萜合成途径中差异表达的基因并阐明其分子机制.结果显示,'西伯利亚'百合通过转录组测序分析共得到56.28 Gb clean base,223.40 Mb clean reads和124233个unigene,其中35749个基因得到注释.萜骨架合成途径中的基因表达水平在不同花期表现出显著差异.其中,甲基赤藓糖醇磷酸(MEP)中的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(DXS)、1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(DXR)、4-羟基-3-甲丁-2-烯基二磷酸合成酶(HDS)、4-羟基-3-甲丁-2烯基二磷酸还原酶(HDR)、牻牛儿基二磷酸合成酶(GPS)基因的表达水平随花期变化呈先升高后降低的趋势.罗勒烯合成酶(OCS)基因表现出相似变化规律,在盛开期表达量最高.甲羟戊酸(MVA)途径中的3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)的基因表达同样出现先升高后降低的趋势.单萜合成下游的分支途径中,茄尼基二磷酸合成酶(SDS)、牻牛儿基牻牛儿基二磷酸合成酶(GGDR)基因的表达则出现相反的趋势,在盛开期的表达量最低.研究结果表明MEP途径中的关键基因可随花期变化规律性的表达,以调控单萜的生物合成,在盛开期有较高释放量,且盛开期MVA途径的活化以及泛醌和萜醌代谢支路基因的低表达也促进了单萜的生物合成.
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文献信息
篇名
不同花期'西伯利亚'百合花瓣单萜合成途径转录组分析
来源期刊
植物科学学报
学科
生物学
关键词
'西伯利亚'百合
花香
单萜
转录组测序
差异表达基因分析
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
遗传与育种
研究方向
页码范围
252-263
页数
12页
分类号
Q943.2
字数
语种
中文
DOI
10.11913/PSJ.2095-0837.2018.20252
五维指标
作者信息
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姓名
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1
冷平生
北京农学院园林学院
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胡增辉
北京农学院园林学院
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唐彪
北京农学院园林学院
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'西伯利亚'百合
花香
单萜
转录组测序
差异表达基因分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
植物科学学报
主办单位:
中国科学院武汉植物园
湖北省植物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
2095-0837
CN:
42-1817/Q
开本:
大16开
出版地:
武汉市74006信箱
邮发代号:
38-103
创刊时间:
1983
语种:
chi
出版文献量(篇)
2461
总下载数(次)
2
总被引数(次)
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