结核分枝杆菌Rv3607c B细胞表位预测及分析

• 作者: 余晓丽 占卫红 吴启航 张露 李海波 赵隆麒 郑辉
• 来源期刊: 武汉轻工大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 结核分枝杆菌 Rv3607c B细胞表位
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 20-24
• 页数: 5页
• 分类号: R378.911
• 字数: 2896字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-7386.2018.02.004

摘要

预测和筛选结核分枝杆菌Rv3607c的B细胞表位,预测和分析得出其优势B细胞线性表位和构象性表位.在 NCBI数据库中获得结核分枝杆菌的Rv3607c蛋白序列,使用生物信息学在线软件辅助分析.采用SSPro方案预测Rv3607c蛋白二级结构,Bcepred软件分析Rv3607c各个氨基酸的亲水性、柔韧性、可及性、转角、极性、抗原性等物理化学性质预测蛋白B细胞线性表位,ABCpred服务器利用人工神经网络预测抗原序列中的线性B细胞抗原决定区域,综合SSPro、Bcepred和ABCpred的分析情况进行预测,确定了3个优势B细胞线性表位,分别为:GAEIADHVMDDQRVHA77 -92、AAEIVAGPPRKLIETV61 -76、GRHGVYD-HERVAGQRF14 -29.另使用EpiSearch方案利用噬菌体展示肽序列自动检测得到优势构象性表位1个,即G9,T11,G14,G26,R28,V30,D32,A62,I64,A66,I73,E74,T75,A96,D110,V111,A112, V113.笔者对Rv3607c蛋白的B细胞线性表位及构象性表位进行分析并获得多个可能的优势B细胞表位,以期为结核病预防性疫苗的制备及诊断靶标筛选提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余晓丽	武汉轻工大学生物与制药工程学院	23	32	3.0	4.0
2	赵隆麒	武汉轻工大学生物与制药工程学院	7	7	2.0	2.0
3	李海波	武汉轻工大学生物与制药工程学院	8	8	2.0	2.0
4	吴启航	武汉轻工大学生物与制药工程学院	7	7	2.0	2.0
5	占卫红	武汉轻工大学生物与制药工程学院	8	11	2.0	3.0
6	郑辉	武汉轻工大学生物与制药工程学院	6	5	1.0	1.0
7	张露	武汉轻工大学生物与制药工程学院	6	5	1.0	2.0