不同播期条件下大豆开花期性状的全基因组关联分析

• 作者: 刘丽凤 孙石 宋晓宇 李晓那 毛婷婷 王立伟 韩天富
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 播期 开花期 全基因组关联分析 候选基因
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 459-468
• 页数: 10页
• 分类号: S565.1
• 字数: 6946字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2018.04.001

摘要

开花期是决定大豆生态适应性和产量的重要性状,研究大豆开花期的遗传规律,解析大豆开花调控的分子基础,对大豆品种适应性改良具有重要意义.本研究选用来自北方、黄淮海和南方三大生态区的87份中国品种及31份美国大豆品种,在北京进行春、夏季分期播种,获得10个播期环境下的开花期数据,并利用Illumina BARC-SoySNP6K iSelectBeadChip芯片对大豆品种进行SNP分型.通过群体结构分析、聚类分析和PCA分析,将供试大豆品种分为两个亚群.利用TASSEL软件PCA+K模型,结合5126个SNP标记,对开花期进行全基因关联分析,得到18个显著关联位点,其中14个位点在2个以上的环境中稳定表达,4个位点只在单一环境中被检测到,表明其受光温环境影响较大.18个位点中有11个尚未见报道,分别位于3、4、5、9、10、14、16和17号染色体上,可能存在控制大豆开花期的新基因.通过对显著关联位点进行预测,共发现31个候选基因,其中有2个(Glyma10g36600和Glyma19g37890)已在此前的研究中被证明与大豆开花有关,而Glyma03g33470、Glyma11g15650、Glyma05g01510和Glyma19g07162与拟南芥中相关的开花调控基因同源,推测这4个基因在大豆中也参与开花调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙石	中国农业科学院作物科学研究所	9	61	5.0	7.0
2	宋晓宇	东北农业大学农学院	2	23	2.0	2.0
6	毛婷婷	东北农业大学农学院	1	4	1.0	1.0
10	王立伟	中国农业科学院作物科学研究所	1	4	1.0	1.0
11	刘丽凤	中国农业科学院作物科学研究所	1	4	1.0	1.0
12	李晓那	中国农业科学院作物科学研究所	1	4	1.0	1.0
13	韩天富	东北农业大学农学院	1	4	1.0	1.0