林木多元性状数据QTL区间作图统计分析及其在杨树上的应用

• 作者: 刘粉香 吴吉妍 姚丹 童春发 陶申童
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 多元性状数据 QTL定位 杨树 R语言
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 67-72
• 页数: 6页
• 分类号: S722
• 字数: 5398字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201705020

摘要

[目的]传统的数量性状基因座(QTL)定位统计分析方法是针对自交系产生实验群体而建立的,不能直接应用到林木这种杂合度较高生长周期较长的异交物种中.针对林木多元性状数据,将传统的QTL区间作图方法应用到林木杂交F1代作图群体中.[方法]考虑分子标记各种可能的分离比以及连锁相信息,建立林木多元性状数据QTL定位统计分析模型,并用R语言编写了相应的计算软件包mvqtlmap.在美洲黑杨和小叶杨杂交F1代群体中,对2014年5月29日至9月24日期间调查的6个时间点树高数据进行了QTL定位分析.[结果]有4个QTL定位在母本美洲黑杨的遗传连锁图谱上,有6个QTL分布在父本小叶杨的遗传连锁图谱上,这些QTL分别位于第1、5、7、9、11和19号染色体上,平均解释0.8％～6.7％的表型方差.[结论]研究结果可为在林木上利用多个性状或多个时间点性状数据进行QTL定位提供统计分析方法及计算工具.所建立的程序包可在网站http://www.bioseqdata.com/mvqtlmap/mvqtlmap.htm上自由下载.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	童春发	南京林业大学林学院	20	170	8.0	12.0
2	刘粉香	南京林业大学林学院	9	15	2.0	3.0
4	吴吉妍	南京林业大学林学院	2	1	1.0	1.0
5	姚丹	南京林业大学林学院	2	1	1.0	1.0
8	陶申童	南京林业大学林学院	1	1	1.0	1.0