小麦粒重相关基因TaCYP78A16的克隆和CAPS标记开发

• 作者: 刘香利 司文洁 吴林楠 张亚婷 赵惠贤 郭利建 马猛
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦 粒重 小麦细胞色素P450单加氧酶基因(TaCYP78A16) SNP 酶切扩增多态性序列(CAPS)功能标记
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1659-1669
• 页数: 11页
• 分类号: S512.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.10.003

摘要

粒重是小麦(Triticum aestivum)产量的重要构成要素,为了开发小麦粒重性状相关的功能标记,本研究通过小麦全基因组预测并克隆得到1个潜在粒重相关基因:小麦细胞色素P450单加氧酶基因(Triticumaestivum cytochrome P450 78A16,TaCYP78A16;GenBank No.MH572527),并对其进行基因结构、表达模式、等位变异分析和粒重性状相关功能标记开发.结果表明,TaCYP78A16基因在小麦幼穗和籽粒发育初期高表达,可能参与籽粒发育、影响粒重;对30个小麦品种中TaCYP78A16基因编码区和启动子等位变异进行分析,发现仅TaCYP78A 16-A启动子16Ap检测到7个位点的等位变异;根据7个等位变异中的2个SNP位点(SNP2,SNP3)开发了单核苷酸多态性-酶切扩增多态性序列(single nucleotide polymorphisms-cleaved amplified polymorphic sequences,SNP-CAPS)分子标记CAPS-16Ap,该分子标记可将30个小麦品种16Ap序列分成3种基因型:16Ap-Hap1、16Ap-Hap2和16Ap-Hap3;进一步在323个小麦品种中进行验证,结果显示,CAPS-16Ap标记可用于小麦16Ap序列3种基因型的鉴定.本研究将有助于小麦分子标记辅助选择育种.