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肠道中乳酸杆菌属特异性定量引物的筛选及验证
肠道中乳酸杆菌属特异性定量引物的筛选及验证
作者:
孙志宏
张和平
白晓晔
钟智
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
乳酸杆菌属
特异性
引物筛选
微滴式数字PCR
验证
摘要:
[目的]乳酸杆菌与人和动物的健康有密切关系,它的存在及含量变化可以作为评价宿主健康的指标之一.在乳酸杆菌定量研究中,特异性引物往往是定量成功的关键.然而,已有引物质量参差不齐,难以保证其特异性.本文旨在通过理论与试验的方法快速筛选出用于定量的乳酸杆菌属特异性引物,同时为今后引物筛选和设计提供理论基础.[方法]查阅文献、挑选出12对基于16S rRNA基因序列设计的乳酸杆菌属引物,通过MEGA 6.0软件确定引物相对位置,计算引物匹配率,以引物相对位置和匹配率为依据重新组合引物,获得理论特异性乳酸杆菌属引物,再通过琼脂糖凝胶电泳和QX200 DropletDigital PCR系统对新组合引物的特异性进行检验.[结果]通过理论与试验相结合的方法确定了一对特异性较好的乳酸杆菌属定量引物Lab1,它的扩增产物大小约300 bp.ddPCR系统检验结果发现其特异性和灵敏性较好,还可以有效定量粪便中的乳酸杆菌.[结论]引物设计理论结合特异性试验这种方法可以快速有效地筛选出特异性较好的引物,同时为今后引物筛选和设计提供理论基础.
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文献信息
篇名
肠道中乳酸杆菌属特异性定量引物的筛选及验证
来源期刊
微生物学报
学科
关键词
乳酸杆菌属
特异性
引物筛选
微滴式数字PCR
验证
年,卷(期)
2018,(11)
所属期刊栏目
益生菌、益生元与人体微生物组
研究方向
页码范围
1997-2010
页数
14页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13343/j.cnki.wsxb.20180237
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节点文献
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特异性
引物筛选
微滴式数字PCR
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
微生物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0001-6209
CN:
11-1995/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
邮发代号:
2-504
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
4459
总下载数(次)
15
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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