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池蝶蚌STAT基因的克隆及功能分析
池蝶蚌STAT基因的克隆及功能分析
作者:
周伟
洪一江
王军花
王小敏
盛军庆
舒福兴
高沁
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
池蝶蚌
HsSTAT
生物信息学分析
亚细胞定位
荧光原位杂交
qPCR
细胞增殖
摘要:
为了探究池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)信号转导及转录激活因子STAT基因的初步功能,通过RACE-PCR技术首次在池蝶蚌中获得STAT的cDNA全长序列(GenBank ID:KY123702),命名为HsSTAT,HsSTAT全长为2752 bp, 5′-非编码区(5′UTR)为121bp, 3′-非编码区3′UTR为264 bp, 开放阅读框(ORF)为2367 bp, 编码788个氨基酸; 生物信息学分析发现该蛋白结构域主要由STAT_int、STAT_alpha、STAT_bind、SH2四个经典保守性功能域组成; 缬氨酸最多占12.9%.色氨酸使用频率为100%.二级结构中α螺旋最多占46.83%、β折叠最少占8.5%.HsSTAT蛋白亲水性指数为- 0.531, 是亲水性蛋白.预测到棕榈酰化修饰位点1个, 小泛素相关修饰序列3个, 磷酸化修饰位点22个.系统进化树分析显示, HsSTAT与光滑双脐螺STAT5B和盘鲍STAT5聚在一支;亚细胞定位结果显示HsSTAT定位于血细胞的细胞质中;荧光原位杂交结果显示HsSTAT主要在细胞核.qPCR结果显示HsSTAT在所有的组织中均有表达, 其在组织中的表达量在肝胰腺中最高, 在血细胞中最低.细胞增殖实验显实验组增殖率为119%,高于对照组.实验已克隆到HsSTAT的全长序列,HsSTAT可能为STAT5亚型, 具有促进SMCC-7721细胞增殖的功能, 推测具有池蝶蚌细胞的信号转导功能参与池蝶蚌的先天免疫.
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池蝶蚌STAT基因的克隆及功能分析
来源期刊
水生生物学报
学科
生物学
关键词
池蝶蚌
HsSTAT
生物信息学分析
亚细胞定位
荧光原位杂交
qPCR
细胞增殖
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
284-292
页数
9页
分类号
Q718
字数
7083字
语种
中文
DOI
10.7541/2018.036
五维指标
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期刊影响力
水生生物学报
主办单位:
中国科学院水生生物研究所
中国海洋湖沼学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-3207
CN:
42-1230/Q
开本:
大16开
出版地:
湖北省武汉市武昌珞珈山水生所 (武昌东湖南路7号)
邮发代号:
82-329
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
3348
总下载数(次)
8
总被引数(次)
54594
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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