扬子鳄胃蛋白酶原C基因克隆、序列分析及其表达

• 作者: 吴孝兵 孙龙 黄小梅
• 来源期刊: 中国医学科学院学报
• 关键词: 扬子鳄 胃蛋白酶原 基因克隆 序列分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 201-210
• 页数: 10页
• 分类号: Q955
• 语种: 中文
• DOI: 10.3881/j.issn.1000-503X.2018.02.010

摘要

目的 探讨扬子鳄胃蛋白酶原C (PGC)基因的分子克隆和结构特征,研究其系统进化关系和组织定位表达,分析成年扬子鳄在不同生命活动时期胃黏膜组织中PGC基因表达的变化规律.方法 采用反转录PCR和cDNA末端快速扩增技术,从扬子鳄胃黏膜中克隆PGC基因cDNA全长序列;利用生物信息学方法和工具预测其蛋白的理化参数和高级结构;通过Clustal X软件对扬子鳄和其他脊椎动物PGC氨基酸序列进行序列比对,使用MEGA6软件构建系统进化邻接树;应用免疫组织化学法对扬子鳄胃黏膜组织中PGC进行组织定位;用实时定量PCR法检测PGC mRNA在不同生命活动时期胃黏膜组织中的表达水平.结果 从扬子鳄胃黏膜中克隆并获得扬子鳄PGC基因cDNA序列,该序列全长1568 bp,其中开放阅读框1167 bp,编码388个氨基酸;递交GenBank数据库,获得登录号为KY799383.扬子鳄PGC蛋白相对分子质量为41 998,理论等电点为4.16.同源建模法预测该蛋白具有2个天冬氨酸催化活性位点及6个必需半胱氨酸残基位点.系统进化关系表明,扬子鳄PGC氨基酸序列与密河鳄紧密聚为一支,然后与其他鳄类聚在一起.扬子鳄PGC特异性地表达于胃黏膜组织,且繁殖期与冬眠期表达差异有统计学意义(P＜0.05).结论 扬子鳄PGC基因具有高度保守性,其蛋白是胃特有的一种具有消化功能的天冬氨酸蛋白酶.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴孝兵	安徽师范大学生命科学院安徽省重要生物资源保护和利用重点实验室	117	1430	20.0	33.0
2	黄小梅	皖南医学院基础医学院病理教研室	25	106	6.0	9.0
3	孙龙	安徽师范大学生命科学院安徽省重要生物资源保护和利用重点实验室	1	0	0.0	0.0