斑鳜胃蛋白酶原C及其5'侧翼区的克隆及序列特征分析

• 作者: 吴雪峰 赵金良 邓燕飞
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 斑鳜 胃蛋白酶原C 5'侧翼区 启动子
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 页码范围: 641-648
• 分类号: S917
• 字数: 4253字
• 语种: 中文

摘要

采用RT-PCR和RACE等技术克隆了斑鳜(Siniperca scherzeri)胃蛋白酶原C(pepsinogen C,PGC)的cDNA全长和部分DNA序列,结果表明:PGC cDNA序列全长1 505 bp,5'端非翻译区37 bp,3'端非翻译区304 bp,开放阅读框架(ORF)1 164 bp,共编码含有387个氨基酸的蛋白质,包括由16个氨基酸组成的信号肽、39个氨基酸的激活肽和332个氨基酸的成熟肽.斑鳜PGC氨基酸序列与斜带石斑鱼、伯氏豚虾虎鱼、狼鲈、美洲红点鲑4种鱼的相似度分别为92.0%、91.5%、90.2%、89.1%,与非洲爪蟾、鸡、人、兔、褐家鼠的序列相似度分别为76.8%、72.8%、72.5%、69.9%、67.3%,表明PGC基因在长期的进化中较为保守.PGC基因由9个外显子和8个内含子组成,内含子剪切位点符合GT-AG规则,在第7含子中发现(GACA)6、(CA)6类型的微卫星序列,第8内含子中发现(TG)5类型的微卫星序列.采用锚定PCR方法获得了PGC 5'侧翼区长1 924 bp的序列,启动子区域位于-40～+10 bp,包含TATA盒以及GATA-1、CdxA、Hand1/E47、AP-1、Nkx-2、S8、FOX J2等转录因子的结合位点.结果为进一步研究该基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵金良	上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室	64	384	11.0	14.0
2	邓燕飞	上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室	5	47	5.0	5.0
3	吴雪峰	上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室	2	16	2.0	2.0