猪POU1F1基因5'侧翼区克隆及序列分析

• 作者: 吴晗 孙丽亚 宋成义 李碧春 王宵燕 谢飞 赵芹 高波
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 猪 POU1F1基因 5'侧翼区 克隆 序列比对
• 年，卷（期）: 2009,（3）
• 页码范围: 186-189
• 页数: 4页
• 分类号: Q75
• 字数: 3304字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2009.03.006

摘要

POU1F1基因是POU基因家族的成员之一,对哺乳动物的早期发育和相关基因启动表达起重要的调控作用.本文利用染色体步移技术,从长白猪基因组中首次克隆到了约1.5kb的POU1F1基因5'侧翼区序列,并利用相关软件对其进行了序列分析和物种间POU1F1基因5'侧翼区序列比对及进化树构建.结果表明所克隆的片段中含典型的TATA盒(-57)和类CAAT盒序列(-87).TESS软件分析发现在启动子附近有一系列潜在的重要的转录因子结合位点.序列比对结果表明不同物种POU1F1基因的转录起始点上游-150bp区域保守性较强,可能是启动子的核心序列.其中猪与牛的同源性最高,其次是黑猩猩、人、狗,与大鼠、小鼠和鸡同源性较低,与斑马鱼序列同源性最低.同源序列主要集中在转录起始点上游-150bp至-1000bp区域.Vista中的MLAGAN程序构建的系统进化树真实反应了物种间进化关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李碧春	扬州大学动物科学与技术学院	189	1267	18.0	27.0
2	高波	扬州大学动物科学与技术学院	64	338	9.0	15.0
3	谢飞	扬州大学动物科学与技术学院	10	54	5.0	7.0
4	宋成义	扬州大学动物科学与技术学院	80	646	13.0	22.0
5	吴晗	扬州大学动物科学与技术学院	12	47	5.0	6.0
6	孙丽亚	扬州大学动物科学与技术学院	5	28	3.0	5.0
7	王宵燕	扬州大学动物科学与技术学院	56	258	8.0	13.0
8	赵芹	扬州大学动物科学与技术学院	4	25	3.0	4.0