牛FATP1基因5'侧翼启动子克隆及序列分析

• 作者: 张勇 许厚强 赵佳福 陈伟 陈祥 骆衡 龚婷
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 牛 克隆 FATP1基因 启动子 转录因子
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 86-92
• 语种: 中文

摘要

旨在克隆牛FATP1基因5′侧翼启动子,研究其特异性转录调控元件的调控机制.利用PCR方法扩增牛FATP1基因5′侧翼区,并通过产物纯化、连接、转化及测序比对,获得2 164bp(-1 969-+194 bp)的5′侧翼启动子序列.利用生物信息软件对获得的2 164 bp 5′侧翼启动子克隆载体进行分析预测,发现其有4处转录起始点和40个潜在转录因子结合位点；该序列与人、小鼠、大鼠和狗的同源性分别为74.1％、71.1％、72.0％、62.8％,且不同物种FATP1基因5′侧翼区的同源序列主要集中在转录起始点上游-578--93 bp区域,保守性较强的区域在转录起始点上游-263--174 bp,推测转录起始点上游-263--174 bp可能是其核心启动子区域,从而成功克隆了FATP1 5 ′侧翼启动子序列2 164bp,初步预测了该基因的核心启动子区域.