牛GDF5基因启动子的克隆与序列分析

• 作者: 亐开兴 刘永峰 唐中林 崔文涛 张莺莺 昝林森 李林强 杨述林 牟玉莲 赵栓平
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牛 GDF5基因 启动子 克隆 转录因子
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 392-397
• 分类号: S823|Q523.8
• 字数: 3520字
• 语种: 中文

摘要

旨在了解生长分化因子5(GDF5)可能的调控序列.本研究通过基因组比对,扩增了牛GDF5基因5'侧翼区,并通过产物纯化、连接、转化及测序比对,确定了2 043 bp的启动子序列.同时综合考虑已经证实的人GDF5基因启动子结构及应用启动子在线分析软件,对该序列进行分析.结果发现,牛GDF5基因5'侧翼区没有CpG岛,序列比对发现,牛和人GDF5基因启动子区域同源性为78%;牛GDF5基因启动子没有TATA box或CAAT box结构,其转录起始位点位于翻译起始密码子ATG上游-359 bp位置,其潜在的转录因子有AML-la,Ap-1,AmL-la,CdxA,SRY,CdxA,TATA,AmL-la,GTATA-1,MZF1,CdxA,Nkx-2,CdxA,S8和SRY,其中Ap-1,AmL-la,SRY,Nkx-2,S8和SRY高度保守,与人的序列完全一致;推测发现牛GDF5基因启动子-457至-423 bp序列中的GT重复序列可以增强启动子的活性,且最小增强子处于-458和-377 bp之间.研究结果推测判定了牛GDF5基因启动子的转录起始位置、转录结合位点、活性序列及最小增强子序列,为以后深入研究GDF5基因在牛软骨细胞中的表达机制提供了理论基础.