芸薹根肿菌SSR标记的开发及遗传多样性研究

• 作者: 庞文星 张椿雨 战宗祥 朴钟云 李晓楠 马坡
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芸薹根肿菌 基因组 SSR 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 土肥植保
• 页码范围: 872-878
• 页数: 7页
• 分类号: S35.654
• 字数: 5267字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2018.06.018

摘要

芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae)专性寄生于十字花科作物根部引起根肿病,且变异迅速.本研究利用Williams鉴别寄主系统鉴定了32株根肿菌,根据根肿菌基因组序列分析了根肿菌基因组中简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)的分布特性,并结合SSR标记开发研究了根肿菌遗传多样性.主要结果:从收集自8个省市31个地区的32株根肿菌中,鉴定出2、4、7和11号生理小种;根肿菌基因组存在3 164个SSR,即每7.6 kb存在1个SSR.核苷酸重复类型以2和3为主,分布频率分别为45.92％和53.04％.从62对SSR引物中,筛选出31个多态性标记,多态率50％,平均PIC值为0.407;聚类分析表明,同一地区的根肿菌大多聚类到一起,但同时存在变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张椿雨	华中农业大学植物科学技术学院	10	259	8.0	10.0
2	朴钟云	沈阳农业大学园艺学院	60	409	12.0	17.0
3	庞文星	沈阳农业大学园艺学院	7	5	1.0	2.0
4	战宗祥	沈阳农业大学园艺学院	3	12	2.0	3.0
5	马坡	沈阳农业大学园艺学院	1	4	1.0	1.0
6	李晓楠	沈阳农业大学园艺学院	1	4	1.0	1.0