TCGA数据库中肺腺癌标志物的数据发掘研究

• 作者: 刘岩 李楠 王连友 迟少丽
• 来源期刊: 实用医药杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肺腺癌 长链非编码RNA DGCR5 肿瘤标志物 生物信息学 TCGA数据库
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 综述与讲座
• 页码范围: 847-850
• 页数: 4页
• 分类号: R734.2
• 字数: 2433字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14172/j.issn1671-4008.2018.09.028

摘要

目的 探讨肺腺癌潜在的肿瘤标志物的临床诊断及预后的意义.方法 对TCGA数据库中的RNA-seq数据进行挖掘,寻找在肺腺癌中变异超过10％的lncRNA,选取变异最大的进行PVT1、HCG11、TP53TG1和DGCR5在Oncimne数据库中进行表达差异验证,有显著差异的标准为|log2 fold change|>2,P<0.05,并进行ROC及生存分析以判断其在临床诊断和预后判断中的意义.结果 筛选出PVT1和DGCR5在肺腺癌中有明显差异并对其诊断和预后有显著性影响(P<0.05).结论 PVT1和DGCR5对肺腺癌的诊断和预后有影响,可以作为肺癌预后的生物标志物进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李楠	解放军401医院干部病房三科	4	15	2.0	3.0
2	刘岩	解放军401医院干部病房三科	3	9	2.0	3.0
3	迟少丽	解放军401医院干部病房三科	1	1	1.0	1.0
4	王连友	解放军153医院心内科	1	1	1.0	1.0