洋常春藤鲨烯合成酶基因HhSS的克隆与表达分析

• 作者: 乔飞 孙化鹏 钟晓红
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 洋常春藤 鲨烯合成酶 RACE克隆 实时荧光定量PCR 相对表达量
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2127-2132
• 页数: 6页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.09.023

摘要

目的 克隆获得洋常春藤Hedera helix鲨烯合成酶基因(HhSS) cDNA全长序列并进行生物信息学分析及表达分析.方法 根据洋常春藤转录组数据信息设计引物,通过RACE克隆方法获得HhSS基因序列;采用DNAMAN、PROTPARAM、TMHMM、PSORT、ScanProsite、SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学工具分析序列信息及编码蛋白的理化特性、结构域等特征;通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术进行HhSS基因的检测分析.结果 RACE克隆获得HhSS(GenBank登录号KX056078)基因cDNA序列全长1 889 bp,包含一个从248～1 477 bp的完整开放阅读框(ORF)以及247bp的5'非编码区(5'UTR)和412 bp的3'非编码区(3'UTR).该基因编码409个氨基酸,相对分子质量为46 800,等电点为5.68.HhSS蛋白具有植物SS蛋白的特征结构域和跨膜区,与刺五加、人参等同科植物亲缘关系较近.qRT-PCR结果表明洋常春藤叶片中HhSS基因的相对表达量与常春藤皂苷含量存在正相关性.结论 洋常春藤HhSS基因的成功克隆及表达分析研究,为阐明HhSS基因在常春藤皂苷生物合成途径中的作用及代谢调控研究提供理论依据和技术基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟晓红	湖南农业大学园艺园林学院	123	1123	18.0	29.0
2	乔飞	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室	15	15	2.0	3.0
3	孙化鹏	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开放实验室	4	1	1.0	1.0