猪流行性腹泻病毒变异株GDqy2017的分离及S和ORF3基因序列分析

• 作者: 勾红潮 卞志标 徐志宏 李春玲 李艳 林德锐 楚品品 蒋智勇 蔡汝健
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 分离 S基因 ORF3基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 10-17
• 页数: 8页
• 分类号: S852.659.6|Q786
• 字数: 5664字
• 语种: 中文

摘要

2017年广东某猪场送检腹泻死亡仔猪小肠样本,经实验室检测、细胞分离及RT-PCR鉴定,确定分离到1株猪流行性腹泻病毒,命名为GDqy2017,克隆并测定其S基因与ORF3基因序列,并对序列进行分析.结果显示,该分离株对Vero细胞高度适应,第1代即出现细胞病变(CPE),第4代起1 d内即出现CPE,且CPE时间和形态稳定.其S基因长4158 nt,与经典毒株CV777、中国疫苗株CV777及韩国疫苗株attenuated DR13核苷酸同源性为94.2％、94.1％、94.2％,氨基酸同源性为93.4％、92.7％、93.0％,存在2处插入、2处缺失及98处突变(与经典毒株CV777相比),属于不同进化群,与国内2010年后参考株(除CH-XBC-01-2015、CH/GDQY/2011)在同一进化群,S蛋白的主要抗原表位存在突变,其中有1处新突变出现(640位F→S),其ORF3全长675 nt,不存在疫苗株中的大片段缺失及表达截短现像,但存在突变,进化树分析显示与经典毒株CV777、疫苗株属于不同进化群,亲缘关系较远.研究结果为后续PEDV分子生物学分析、流行病学调查及研制更为有效的疫苗提供基础数据.