针对具有反作用控制系统(Reaction Control System,RCS)和气动舵两类控制机构的再入飞行器,提出一种基于脉宽脉频(Pulse-Width Pulse-Frequency,PWPF)调节器的最优控制分配方法.将RCS的输入信号转化为连续变化量,RCS与气动舵的控制分配问题被描述为二次规划问题,并采用有效集方法对其求解.采用离散法和PWPF调节器将优化结果转化为RCS的开关机状态.与混合整数规划问题相比,连续二次规划问题更容易求解,计算速度更快.通过对二次规划问题的重构,该算法能有效地应对故障情况.