武汉地区丙型肝炎病毒包膜蛋白E1的生物信息学研究

• 作者: 万莉 周小东 蔡国才 雷行华
• 来源期刊: 华中师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 丙型肝炎 生物信息学 武汉 包膜蛋白E1
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 366-372
• 页数: 7页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 6121字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19603/j.cnki.1000-1190.2018.03.013

摘要

使用生物信息学的方法,分析武汉地区不同基因型、亚型的丙肝病毒的包膜E1蛋白,预测其二级结构、核苷酸变异性、糖基化位点、亲水性、跨膜区、信号肽、蛋白修饰位点、B细胞抗原.结果显示各HCV的包膜E1蛋白二级结构差距不大;序列始末段有数个氨基酸残基的差距,序列上存在高变异位点,基因型2a的型内一致性最高;序列大量糖基化,有多个糖基化基化位点;序列分布着亲水性区域,基因型1b的分值很高;基因型1b、6a、3b、3a多数亚型有1个跨膜区,基因型2a多数亚型有两个跨膜区;基因型1b、6a、3b、3a无信号肽,基因型2a都有信号肽;蛋白序列上存在多个不同修饰位点和B细胞抗原,各基因型、亚型之间有明显差距,具有较大异质性.该研究为揭示病毒感染机制和研制地区性疫苗提供一定的科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	万莉	成都医学院检验医学院	19	69	5.0	7.0
2	周小东	成都医学院检验医学院	20	46	5.0	5.0
3	雷行华		16	53	5.0	7.0
4	蔡国才		2	7	1.0	2.0