G.41×新疆野苹果树体生长性状的QTL精细定位及候选基因预测

• 作者: 李翠英 梁微 王京 符轩畅 董丽娟 董军 马百全 马锋旺
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 苹果砧木 SSR 遗传图谱 QTL 候选基因
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 2155-2163
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2018.11.013

摘要

[目的]矮化砧木可以诱导地上部接穗品种矮化,实现苹果的丰产和稳产.因此,深入挖掘调控苹果树体生长的基因,可以改善苹果树形,加强苹果园地的管理方便性.[方法]以矮化苹果砧木‘G.41’和乔化苹果砧木新疆野苹果(Malus sieversii)为亲本构建的1 88株F1代分离群体为试材,并于每个分离群体植株上嫁接‘富士冠军’.基于SSR标记技术,采用Join Map 4.0作图软件构建苹果遗传连锁图,应用Map QTL 5.0作图软件,结合后代群体的表型数据,对接穗高度和接穗横截面积生长性状进行初步QTL定位.结合苹果基因组序列信息,利用PrimerS.0软件进行新SSR标记开发,并对初步定位区域进行精细定位及候选基因预测.[结果]该研究从361对SSR引物中筛选出1 08对在亲本之间表现出多态的SSR引物,多态率为29.9％.其中95对引物用于遗传连锁图谱构建,并在5号连锁群上初步检测出4个与植株生长性状相关的QTL位点,与接穗高度、接穗横截面积性状紧密连锁的两个标记,为L05024和Hi09b04.根据初步定位区域的序列信息,设计了新的SSR引物24对,其中在亲本间表现出多态的有10对,利用该10对引物对5号连锁群重新分析.构建了包含21个SSR标记、总长为86.0 cM的高密度遗传图谱,其平均遗传距离为7.52 cM.通过对接穗高度与接穗横截面积生长相关性状的QTL分析,在SSR标记L05024和Hi09b04之间找到与其相关的QTL位点,其表型贡献率分别为19.2％和51.7％.将该QTL位点与基因组序列对比,发现其物理距离为543 kb,并且该QTL区间包含16个候选基因.推测其中MDP0000323212为与植株生长密切相关的基因.[结论]本研究将砧木诱导矮化基因定位于苹果第5号染色体543 kb区段内,侧翼标记分别为L05024和Hi09b04,其物理距离为4.048-4.591 Mb,并筛选到可能参与调控植株生长的候选基因MDP0000323212.