苹果柱型基因候选基因的筛选

• 作者: 仇占南 付艳 朱元娣 李晨辉 杜传慧 王利敏
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 柱型性状 Co区域 差异表达 候选基因
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 53-63
• 页数: 11页
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.01.006

摘要

苹果(Malus×domestica Borkh.)柱型生长性状受位于10号染色体上的单显性基因Co(Columnar)控制,Co区域内有多个预测基因.筛选与苹果柱型性状相关的候选基因,为确定Co的身份,提供理论依据.通过NCBI中的序列阅读存档/表达序列标签(sequence read archive/expressed sequence tags,SRA/EST)数据库检索Co区域(18.51～19.1 Mb)的64个预测基因;以柱型苹果威赛克和非柱型苹果旭的茎尖、叶片、芽为试材,分别提取RNA,反转录后等体积混合作为cDNA混合样,用于反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)扩增预测基因的cDNA序列;利用实时荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)分析苹果茎尖组织中的基因差异表达.通过SRA/EST数据库检索,筛查到在不同苹果组织或器官中表达的32个预测基因;RT-PCR扩增获得29个预测基因的cDNA序列;qRT-PCR分析获得15个在柱型苹果茎尖中差异表达显著的基因,其中6个基因(26号、41号、33号、38号、28号和32号基因)上调显著,9个基因(30号、9号、37号、6号、44号、10号、27号、11号和4号基因)下调显著.本研究在柱型苹果茎尖中筛选到的15个表达显著的基因,可作为Co候选基因.候选基因的确定旨在阐明Co基因区域的关键基因功能和苹果柱型突变的分子机制,为苹果树型的定向遗传改良服务.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱元娣	中国农业大学园艺学院	29	443	10.0	20.0
2	仇占南	中国农业大学园艺学院	3	18	1.0	3.0
3	李晨辉	中国农业大学园艺学院	3	2	1.0	1.0
4	付艳	中国农业大学园艺学院	3	4	1.0	1.0
5	杜传慧	中国农业大学园艺学院	2	2	1.0	1.0
6	王利敏	中国农业大学园艺学院	2	2	1.0	1.0