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盐胁迫下双峰驼结肠组织环境适应能力研究
盐胁迫下双峰驼结肠组织环境适应能力研究
作者:
凌宇
周欢敏
孟凡华
张焱如
曹俊伟
王申元
齐昱
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
双峰驼
结肠
转录组
盐代谢
摘要:
我国北方中西部畜牧地区的水源多为高含盐量水源,普通家畜不能适应这样的水源,从而影响了北方地区畜牧业的发展.双峰驼(Camelidae bactrianus)作为适应北方高盐水源的物种,其盐适应机制尚不清楚.本研究针对双峰驼盐适应能力,对大量进食食盐与正常条件下双峰驼的结肠组织进行转录组测序及数据分析,从转录组学角度了解大量进盐环境下骆驼结肠组织对盐环境的适应机制.结果显示,进盐组测得reads 52 882 246条,对照组测得51 533 346条;进盐组reads总比对率为86.41%,唯一比对率为84.61%;对照组总比对率为92.48%,唯一比对率为91.62%;进盐组与对照组共获得差异表达基因2 450个,其中上调表达基因1 136个,下调表达基因1 314个.基因本体(Gene Ontology,GO)分析显示,进盐组下调表达基因显著富集的term共17条,上调表达基因显著富集的term共28条.京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析显示,下调表达基因显著富集到的包括剪接体、RNA转运、基础转录因子、真核生物中核糖体的生物合成、RNA降解、氧化磷酸化和蛋白输出功能通路.上述结果表明,在盐胁迫条件下,结肠组织下调表达的基因多于上调表达基因,具有统计意义的生物功能分析显示,下调表达基因多参与RNA过程和蛋白质合成通路.这些基因有利于骆驼在高盐环境下减少RNA的合成,降低结肠组织的代谢速率.本研究对区域特色畜牧品种的盐适应机制进行解析,为高含盐水源畜牧地区育种、提高区域资源利用率提供分子理论依据.
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文献信息
篇名
盐胁迫下双峰驼结肠组织环境适应能力研究
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
双峰驼
结肠
转录组
盐代谢
年,卷(期)
2018,(10)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
1723-1736
页数
14页
分类号
S824
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2018.10.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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1
孟凡华
内蒙古农业大学生命科学学院
14
25
3.0
4.0
2
周欢敏
内蒙古农业大学生命科学学院
86
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10.0
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王申元
内蒙古农业大学生命科学学院
10
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曹俊伟
内蒙古农业大学生命科学学院
8
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2.0
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张焱如
内蒙古农业大学生命科学学院
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齐昱
内蒙古农业大学生命科学学院
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凌宇
内蒙古农业大学生命科学学院
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研究主题发展历程
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双峰驼
结肠
转录组
盐代谢
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
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