转录组揭示禁水环境下双峰驼结肠组织适应机制

• 作者: 凌宇 周欢敏 张焱如 曹俊伟 王申元 齐昱
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 双峰驼 结肠 转录组 水代谢
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 2359-2370
• 页数: 12页
• 分类号: S824.2
• 字数: 6766字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2018.11.007

摘要

旨在了解骆驼属在缺水条件下组织环境适应机制.本研究选取6峰6～9岁的成年阿拉善双峰驼,随机分为2组,第一组为对照组(colon1_3),正常采食饲料与水;第二组为禁水组(colon3),不给骆驼饮水,其他处理(饲草量)与对照组相同,禁水24 d.采用Illumina HiSeq 2000测序平台通过对禁水(试验组)与正常饮水(对照组)条件下双峰驼结肠组织进行转录组测序,并对转录组数据进行质控、比对、差异表达、GO和KEGG分析.结果显示,禁水组与对照组比较共获得差异表达基因2 122个,其中上调表达基因813个,下调表达基因1 309个.GO分析结果显示,禁水组下调表达基因最为显著富集的条目有30条,上调表达基因中未得到统计学意义的富集条目.KEGG富集分析显示,禁水组下调表达基因显著富集到剪接体、蛋白外排、内质网蛋白合成过程、RNA转运、核糖体合成、mRNA检测、RNA降解代谢途径;上调表达基因富集到的通路包含局部细胞黏连、溶酶体功能等.上述结果表明,禁水环境下,结肠组织下调表达基因多于上调表达基因,下调表达基因多参与RNA加工和蛋白质合成,这些功能有利于骆驼在缺水环境下,减少RNA的合成,降低结肠组织的代谢速率.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周欢敏	内蒙古农业大学生命科学学院	86	473	10.0	19.0
2	王申元	内蒙古农业大学生命科学学院	10	31	2.0	5.0
3	曹俊伟	内蒙古农业大学生命科学学院	8	11	2.0	2.0
4	张焱如	内蒙古农业大学生命科学学院	37	228	10.0	14.0
5	齐昱	内蒙古农业大学生命科学学院	7	8	2.0	2.0
6	凌宇	内蒙古农业大学生命科学学院	6	9	2.0	2.0