峨眉山区桑科药用植物ITS2条形码序列鉴定

• 作者: 任瑶瑶 刘睿颖 张良 江南屏 谢博文 谭睿
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 学科: 医学
• 关键词: 桑科 DNA条形码 ITS2序列 二级结构 鉴定 资源调查
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 中药资源
• 页码范围: 140-145
• 页数: 6页
• 分类号: R282
• 字数: 2976字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.2018.01.024

摘要

目的:评价以ITS2序列作为DNA条形码对峨眉山区桑科药用植物的鉴定作用.方法:于四川峨眉山地区采集桑科药用植物样本25个,提取DNA,对其ITS2序列进行PCR扩增并测序,从GenBank上下载23条同科ITS2序列;运用MEGA6.0对所有序列种间种内遗传距离进行计算分析,构建Neighbor Joining (NJ)系统进化树;利用TAXON DNA软件分析所有序列种内、种间变异并作barcoding gap分析;从ITS2数据库中预测并比较样本ITS2序列的二级结构差异.结果:桑科样本种间K2P最小遗传距离(0.041)大于种内最大距离(0.005),并有较为明显的barcoding gap;NJ树显示种各属样本分别聚为一大枝,种内之间于各属分支中各聚为一支;各属及各种样品ITS2二级结构存在明显差异.结论:以ITS2序列作为DNA条形码,能够对桑植物进行准确、快速的识别和鉴定,准确地弄清物种之间的系统进化关系,为峨眉山区该属药用植物的分布、种群及种群量研究提供指导,对其质量控制、安全用药及资源保护及合理开发利用提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张良	西南交通大学生命科学与工程学院	57	513	13.0	21.0
2	谭睿	西南交通大学生命科学与工程学院	129	606	13.0	19.0
3	江南屏	西南交通大学生命科学与工程学院	21	87	6.0	8.0
4	任瑶瑶	西南交通大学生命科学与工程学院	26	68	5.0	7.0
5	刘睿颖	西南交通大学生命科学与工程学院	16	64	5.0	7.0
6	谢博文	西南交通大学生命科学与工程学院	2	2	1.0	1.0