文心兰PAD4基因克隆及表达分析

• 作者: 李蓉 王丛巧 王天池 赖钟雄 郭艳芳 陈裕坤
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 文心兰 抗病 PAD4 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 2436-2445
• 页数: 10页
• 分类号: S31
• 字数: 6546字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.12.016

摘要

为了研究文心兰(Oncidium hybridum)抗病相关基因PAD4在文心兰抗病种质资源培育中的功能,采用RT-PCR结合RACE法,从巧克力文心兰(Oncidium Sharry Baby'Sweet Fragrance')中克隆得到一条全长2214 bp的基因的cDNA序列,开放阅读框长1894 bp,预测可编码647个氨基酸,5′UTR长度为65 bp,3′UTR长度为255 bp.生物信息学分析表明:PAD4编码的蛋白属于水解酶超家族,有6个跨膜螺旋,无信号肽,亚细胞定位预测其主要定位于细胞质膜上.系统进化树表明,文心兰PAD4与同为兰科植物的小兰屿蝴蝶兰(Phalaenopsis equestris)、铁皮石斛(Dendrobium catenatum)、深圳拟兰(Apostasia shenzhenica)亲缘关系最近.同源分析结果显示,与铁皮石斛的PAD4蛋白同源性最高(78.08％).实时荧光定量PCR分析显示,PAD4在文心兰不同组织部位中都有表达,在假鳞茎中的表达量最高,其次是下端叶,在根中的表达量最低.接种软腐病病原菌显示,PAD4在感病文心兰中表达量上调,侵染后4 h时快速响应并达到最高值.SA(salicylic acid)和CaCl2都能够诱导PAD4的表达,都在24 h时达到最高峰.研究表明,PAD4基因可能在文心兰抗病过程中有重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	陈裕坤	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	48	97	5.0	7.0
3	王天池	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	12	42	4.0	6.0
4	郭艳芳	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	3	1	1.0	1.0
5	王丛巧	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	3	2	1.0	1.0
6	李蓉	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	10	6	2.0	2.0