单心室患儿肠道菌群结构特征分析

• 作者: 孙崇蕊 张明杰 徐卓明
• 来源期刊: 临床小儿外科杂志
• 关键词: 单心室 心脏病/先天性 肠道菌群 高通量测序
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 620-625
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-6353.2018.08.015

摘要

目的 通过Illumina高通量测序技术提取单心室和双心室患儿粪便样本中细菌总DNA,比较两组患儿肠道菌群的异同.方法 选取在本院行全腔静脉肺动脉连接术的单心室患儿20例(男11例,女9例,年龄3～10岁)作为单心室组,选取同期在本院性别相同、年龄(±1岁)相匹配的双心室患儿作为双心室组,收集患儿粪便标本并提取样本中细菌的DNA,进行16S rRNA高通量测序,获得肠道菌群结构数据.结果 在OTU(operational taxonomic units)水平上,单心室组和双心室组的丰富度指数(Ace:190.88 vs.201.28和Cho:188.27 vs.201.90)、多样性指数(Shannon:3.140 vs.3.090和Simpson:0.109 vs.0.110)、覆盖率指数(Coverage:0.999 vs.0.999)差异均无统计学意义(P>0.05).门水平上两组均以厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门为主要优势菌群,其中蓝细菌门构成比存在统计学差异(P<0.05).在属水平上,两组共检测到224种不同菌属,其中柔嫩梭菌属(9.55％vs14.91％),韦荣氏球菌属(3.08％vs.0.50％),Lachnoclostridium(1.02％vs.2.12％),罗斯伯里氏菌属(0.62％vs.2.51％),嗜胆菌属(0.25％vs.0.05％),放线菌属(0.312％vs.0.008％)等菌属的构成比存在统计学差异(P<0.05).结论 单心室患儿与双心室患儿相比,菌群多样性指数无明显差异,但是菌群结构上发生了一些变化,在门水平、属水平均存在差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐卓明	上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心心胸外科	49	194	7.0	11.0
2	张明杰	上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心心胸外科	11	5	2.0	2.0
3	孙崇蕊	上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心心胸外科	4	0	0.0	0.0