甘蔗烟酰胺转氨酶基因(SoNAAT1)的克隆及其在缺Fe胁迫下表达量变化

• 作者: Mukesh Kumar Malviya 农倩 张艳 李长宁 苏琴 覃丽萍 谢玲 陈艳露
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗 烟酰胺转氨酶 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 653-658
• 页数: 6页
• 分类号: S566.1
• 字数: 4740字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2018.4.003

摘要

[目的]克隆甘蔗烟酰胺转氨酶(Nicotianamine Aminotransferase,NAAT)基因,分析其基本生物学信息及在缺Fe胁迫下的表达量变化,为进一步探讨SoNAAT1基因在甘蔗麦根酸类Fe载体生物合成途径中的作用提供理论依据.[方法]根据前期获得的EST序列设计引物,利用RT-PCR和RACE-PCR获得甘蔗SoNAA T1基因cDNA全长,应用在线软件程序对氨基酸序列进行分析,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析基因在不同缺Fe胁迫时长下的表达情况.[结果]甘蔗SoNAAT1基因全长1593 bp,编码区长度1206 bp,编码401个氨基酸,理论分子量为44.2 kD,等电点为5.64,主要在细胞质中表达,蛋白结构以α-螺旋为主.SoNAA T1与玉米、水稻、高粱的NAAT基因序列具有高度的同源性,系统发育进化树显示其与高粱SbNAAT3优先聚在一起.qRT-PCR分析结果表明,SoNAAT1的表达随着缺Fe胁迫时间的延长而增强,缺Fe胁迫引起甘蔗根系内源ABA含量和相关抗氧化酶活性增加,并与SoNAAT1表达密切相关.[结论]甘蔗SoNAAT1基因编码序列具有较高的保守性,表达量随着缺Fe胁迫时间的延长而增加,推测该基因参与了甘蔗麦根酸类Fe载体生物合成途径的调控过程.