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甘蔗脂氧合酶基因ScLOX1的克隆与表达分析
甘蔗脂氧合酶基因ScLOX1的克隆与表达分析
作者:
孙婷婷
王文举
娄文月
刘峰
张旭
王玲
陈玉凤
阙友雄
许莉萍
李大妹
苏亚春
原文服务方:
作物学报
甘蔗
脂氧合酶
生物信息学
实时荧光定量PCR
生物和非生物胁迫
摘要:
LOX属于脂氧合酶超家族(lipoxygenase superfamily),是脂肪氧化途径的重要因子,广泛参与植物生长发育的调节和对外界刺激的抵御。本研究基于甘蔗(Saccharum spp.)转录组数据库,通过RT-PCR技术,首次从新台糖22号(ROC22)蔗芽中克隆获得ScLOX1基因(GenBank登录号为MK106188)的cDNA全长序列。生物信息学分析显示,ScLOX1基因cDNA序列长度为2813bp,开放读码框全长2664bp,编码887个氨基酸,其编码蛋白的理论等电点为6.23,不稳定系数为39.77,亲水性平均值为0.437,无信号肽和跨膜结构,但含有PLAT_LH2和Lipoxygenase活性位点,与高粱(Sorghum bicolor)LOX(XP_002466613.1)的氨基酸序列相似性高达95.96%。预测ScLOX1基因的编码蛋白为酸性稳定亲水性非分泌蛋白,属于typeI类非传统9-LOX。qPT-PCR分析结果显示,ScLOX1基因在蔗芽组织中特异性表达。接种甘蔗黑穗病菌(Sporisorium scitamineum)后,ScLOX1基因的表达量在抗病品种崖城05-179中短暂上升,但在感病品种ROC22中显著下降。分别对瞬时表达ScLOX1基因的本氏烟(Nicotiana benthamiana)植株叶片接种烟草茄病镰刀菌蓝色变种(Fusarium solani var.coeruleum)和青枯菌(Ralstonia solanacearum),表型观察、3,3’-二氨基联苯胺(3,3’-diaminobenzidine,DAB)染色和烟草免疫相关基因的表达情况分析显示,ScLOX1基因的过表达能够增强本氏烟对烟草茄病镰刀菌蓝色变种的防御,但对烟草青枯菌的作用与对照相比无明显差异。研究还发现,ScLOX1基因的表达受茉莉酸甲酯和水杨酸抑制下调,但受脱落酸、氯化钠和聚乙二醇诱导上调。以上结果为深入研究甘蔗ScLOX1基因的功能提供参考资料。
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文献信息
篇名
甘蔗脂氧合酶基因ScLOX1的克隆与表达分析
来源期刊
作物学报
学科
关键词
甘蔗
脂氧合酶
生物信息学
实时荧光定量PCR
生物和非生物胁迫
年,卷(期)
2021,(7)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
1002-1016
页数
14页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2019.84143
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
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研究主题发展历程
节点文献
甘蔗
脂氧合酶
生物信息学
实时荧光定量PCR
生物和非生物胁迫
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
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