肥胖患者内脏脂肪细胞来源的外泌体miRNAs表达谱分析

• 作者: 刘继军 吕静 王冀邯 王阳阳 赵和平 郭磊 黄云飞
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肥胖 内脏脂肪 外泌体 miRNAs 功能注释
• 年，卷（期）: 2018,（21）
• 所属期刊栏目: 论著·临床研究
• 页码范围: 2604-2609
• 页数: 6页
• 分类号: R394
• 字数: 4743字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2018.21.004

摘要

目的 探讨肥胖人群内脏脂肪细胞分泌的外泌体中miRNAs表达谱的改变,寻找与肥胖相关的差异表达miRNAs,为肥胖及其相关疾病发病机制的探讨和有效预防提供理论基础.方法 运用R/Bioconductor软件平台对美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共数据平台中的GEO芯片数据集GSE50574进行差异miRNAs表达谱分析,使用3个主要的生物信息学网站(TargetScan、miRDB和miRWalk)对差异表达miRNAs进行靶基因预测,基于Cytoscape软件构建差异表达miRNAs-target genes调控网络,通过DAVID注释工具对网络中的基因进行功能注释.结果 与健康对照相比,肥胖患者内脏脂肪细胞分泌的外泌体miRNAs表达谱显示19个miRNAs表达水平发生显著变化(倍数改变＞2,P＜0.05),其中1个miRNA表达水平上调,18个miRNAs表达水平下调.借助于miRNA靶基因预测网站对19个差异表达miRNAs靶基因进行预测,共得到潜在靶基因919个.分别对表达上调和下调的两组差异表达miRNAs及其靶基因进行调控网络图的绘制和DAVID功能注释,结果提示上调组miRNA分别参与了3个KEGG通路和17个基因本体论(GO)_生物学过程(BP)、5个GO细胞组分(CC)、9个GO_分子功能(MF)注释条目(P＜0.05),下调组miRNAs分别参与了13个KEGG通路和73个GO_BP、18个GO CC、30个GO_MF注释条目(P＜0.05).结论 肥胖患者内脏脂肪细胞分泌的外泌体miRNAs表达谱系与健康对照具有显著差异.借助高通量组学和相关数据库的联合运用,对内脏脂肪细胞及其功能作用有了更深入的了解,并为肥胖及肥胖相关疾病的发病机制研究提供了新的视角.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕静	西安交通大学附属红会医院检验科	7	36	3.0	6.0
2	赵和平	西安交通大学附属红会医院检验科	20	104	5.0	9.0
3	郭磊	西安交通大学附属红会医院脊柱外科	20	354	10.0	18.0
4	王冀邯	西安交通大学附属红会医院检验科	10	12	2.0	3.0
5	刘继军	西安交通大学附属红会医院脊柱外科	13	70	5.0	8.0
6	黄云飞	西安交通大学附属红会医院脊柱外科	4	6	2.0	2.0
7	王阳阳	电信科学技术第十研究所多媒体技术部	2	2	1.0	1.0