基于ITS2序列的滨海白首乌及其近缘种DNA分子鉴定

• 作者: 刘琪 杨兵 王小浩 祁乃喜 谷巍
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 滨海白首乌 萝藦科 近缘种 ITS2 物种鉴定
• 年，卷（期）: 2018,（24）
• 页码范围: 5901-5909
• 页数: 9页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.24.025

摘要

目的 采用ITS2条形码鉴定滨海白首乌及其近缘种药用植物.方法 采集滨海白首乌Cynanchum auriculatum及其近缘种植物样品共54份,分别提取基因组DNA,通过PCR扩增ITS2序列并进行双向测序,测序结果提交至GenBank;从GenBank下载萝藦科植物16种47条序列,并通过ITS2数据库注释出ITS2序列;对提交与下载的101条序列,应用MEGA5.0软件进行序列比对,计算种内和种间距离,采用相似性搜索法、最近距离法进行鉴定分析,并构建neighber-joining(NJ)系统进化树直观反映鉴定结果.结果 滨海白首乌ITS2序列长度均为249 bp,是1个单倍型,与萝藦科鹅绒藤属植物距离较近,与萝藦科其他属近缘种之间遗传距离较远,NJ树结果显示滨海白首乌及其近缘种药用植物均可明显区分,表现出良好的单系性,依据ITS2二级结构,也可以直观地将滨海白首乌与萝藦科近缘种区分.结论 ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别滨海白首乌,为保障安全用药提供了新的技术手段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谷巍	南京中医药大学药学院	107	592	13.0	17.0
2	王小浩	南京中医药大学药学院	6	10	2.0	2.0
3	刘琪	南京中医药大学药学院	7	15	2.0	3.0
4	祁乃喜		4	26	2.0	4.0
5	杨兵		1	2	1.0	1.0