基于高通量测序的青叶胆转录组研究

• 作者: 严媛 刘小莉 吴昕怡
• 来源期刊: 中国现代应用药学
• 学科: 医学
• 关键词: 青叶胆 转录组 Illumina Hiseq 2500 獐牙菜苦苷
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 中药
• 页码范围: 363-369
• 页数: 7页
• 分类号: R915
• 语种: 中文
• DOI: 10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2018.03.012

摘要

目的 探讨青叶胆中獐牙菜苦苷生物合成的遗传基础.方法 采用Illumina Hiseq 2500高通量测序技术,对青叶胆全草进行转录组测序.结果 共获得68 643个unigene,平均长度901 bp,共有42 954条unigene注释到NR,SwissProt,COG,KOG,GO,Pfam数据库中,獐牙菜苦苷生物合成的3个阶段中,有43条unigene参与中间体的生成,3条unigene参与萜类骨架合成,25条unigene可能参与萜类最后的修饰.结论 首次对青叶胆转录组进行测序分析,获得了可能参与獐牙菜苦苷生物合成的候选基因,为后续功能基因的挖掘奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘小莉		32	82	5.0	7.0
2	吴昕怡		4	8	2.0	2.0
3	严媛		2	0	0.0	0.0