基于基因芯片的前列腺癌生物信息学分析

• 作者: 徐斌 漆敏
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 前列腺癌 微小核糖核酸 基因芯片 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（16）
• 所属期刊栏目: 论著·基础研究
• 页码范围: 1958-1962
• 页数: 5页
• 分类号: R737.25
• 字数: 3821字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2018.16.007

摘要

目的 利用生物信息学方法分析前列腺癌(PCa)患者与健康男性血清差异表达基因.方法 将该院收治的PCa病例组和对照组血清进行微小核糖核酸(miRNA)和表达谱芯片检测,每组做3个独立生物学重复.对差异表达的基因进行生物信息学分析,并构建miRNA-mRNA互相作用调控网络图.采用Western blot及qRT-PCR方法检测锌指蛋白转录因子编码基因多形性腺瘤基因2(PLAGL2)、miR-135b-3p表达水平.结果 与对照组相比,病例组有11个miRNA、825个mRNA的表达发生显著变化.KEGG富集的通路有Hippo信号通路 、氨基酸生物合成通路等.与对照组相比,病例组PLAGL2水平降低,miR-135b-3p水平升高(P<0.05).PCa血清中PLAGL2表达与PCa患者初诊血清前列腺特异性抗原(PSA)、肿瘤临床分级 、Gleason评分显著相关(P<0.05).结论 miR-135b-3p靶向PLAGL2调控Hippo信号通路可能是导致PCa发生 、发展的重要原因之一.