前列腺癌相关基因及功能的生物信息学分析

• 作者: 何宜宸 周洋 孙浩 张金虎 焦志敏 王诚悦 陈兵海
• 来源期刊: 江苏大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 生物信息学分析 前列腺癌 CACNA1A CRISP3 ADCY5 PIK3CB
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 临床医学
• 页码范围: 258-263
• 页数: 6页
• 分类号: R737.25
• 字数: 3898字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13312/j.issn.1671-7783.y180257

摘要

目的:利用生物信息学方法和体外实验,寻找前列腺癌发生的关键基因.方法:从GEO数据库下载基因芯片数据GSE60502,其中包括48例正常前列腺组织样本和47例前列腺癌组织样本.利用Morpheus(https:∥soft-ware.broadinstitute.org/morpheus/)在线工具分析前列腺癌组织和正常前列腺组织的差异表达基因,然后使用GCBI(https:∥www.GCBI.com.cn)在线进行差异表达基因的基因本体富集论(gene ontology,GO)分析、Pathway分析,对同时参与GO分析和Pathway分析的差异基因取交集,构建基因共表达网络和基因相互作用网络.最后通过CCK8实验进行验证.结果:共筛选出6903个表达差异的基因,差异最大的前15个基因中,有上调基因9个,下调基因6个,其中表达差异最大的基因为CRISP3.GO分析提示差异基因主要参与的分子生物学过程包括小分子代谢过程、信号转导、DNA依赖的转录过程、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调节等.Pathway分析提示差异基因主要参与的通路包括PI3K-Akt信号通路、代谢途径、MAPK信号通路以及Wnt信号通路等.CACNA1A基因位于共表达网络的核心位置,而ADCY5、PIK3CB基因位于基因相互作用网络的核心位置.体外CCK8实验证实下调CACNA1A表达可明显抑制前列腺癌细胞增殖能力.结论:CRISP3、CACNA1A、ADCY5、PIK3CB基因可能是影响前列腺癌发生的关键基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈兵海	江苏大学附属医院泌尿外科	24	60	5.0	6.0
2	周洋	江苏大学医学院	13	11	2.0	3.0
3	孙浩	江苏大学附属医院泌尿外科	62	130	6.0	7.0
4	王诚悦	江苏大学医学院	5	8	1.0	2.0
5	焦志敏	江苏大学医学院	3	4	1.0	2.0
6	张金虎	江苏大学医学院	2	0	0.0	0.0
7	何宜宸	江苏大学医学院	2	0	0.0	0.0