云南草果种质资源的遗传多样性及亲缘关系的SSR分析

• 作者: 张雪梅 徐绍忠 杨志清 杨生超 胡一凡
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 草果 简单重复序列分子标记 遗传多样性 亲缘关系 聚类分析
• 年，卷（期）: 2018,（22）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 5388-5395
• 页数: 8页
• 分类号: R282.12
• 字数: 5089字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2018.22.025

摘要

目的 评价云南草果居群的遗传多样性及亲缘关系.方法 运用7对微卫星引物对24个草果居群进行分析;首先应用GenALEx计算遗传多样性参数,并进行PCoA和AMOVA分析;采用NTsys软件绘制居群聚类图;最后利用Structure软件计算出最佳的K值.结果 24个草果居群的Shannon多样性指数(H)的平均值为0.49,期望杂合度(He)的平均值为0.32;遗传分化系数(Fst)为0.090,基因流(Nm)为2.930.24个草果居群的遗传分化有81％存在于居群内,仅有19％存在于居群间;黄花草果23个居群的遗传一致度(I)为0.631 8～0.9824,遗传距离(D)的范围为0.017 7～0.459 2,而白花草果居群(MG5)与其他23个黄花草果居群一致度均较小,为0.369 7～0.609 0;而居群聚类分析,在遗传距离0.49处,明显地把白花草果与黄花草果分开;Structure聚类得出K=4时,209份黄花草果资源可被分为4个类群.结论 云南黄花草果居群的遗传多样性水平平均偏高;遗传变异主要存在于居群内,而非居群间.根据基因型,黄花草果和白花草果被明显地划分成2类,遗传距离很远;而黄花草果大致被分为4个类群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨志清	云南农业大学农学与生物技术学院	24	109	5.0	9.0
2	徐绍忠	云南农业大学农学与生物技术学院	36	169	7.0	12.0
6	杨生超	云南农业大学云南省药用植物生物学重点实验室	100	747	13.0	22.0
10	张雪梅	云南农业大学农学与生物技术学院	27	260	7.0	16.0
11	胡一凡	云南农业大学农学与生物技术学院	6	9	2.0	3.0