基于SSR和InDel标记的海南荔枝种质资源遗传多样性分析

• 作者: 孙进华 张新春 张蕾 李焕苓 王家保 王果 王树军 田婉莹
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 荔枝 SSR InDel 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 种质资源
• 页码范围: 1343-1356
• 页数: 14页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.016.001343

摘要

为了解232份主要来自海南的栽培荔枝、半野生荔枝和野生荔枝的遗传多样性及其演化地位,摸清荔枝品种中存在的同名异物和同物异名问题;本研究依据获得的荔枝EST序列和基因组序列开发了一批SSR和InDel标记,利用这些标记对232份荔枝种质资源进行了遗传多样性研究;取6个荔枝品种DNA为模板,筛选出18对SSR引物和12对InDel引物应用于遗传多样性研究,检测到基因位点141个,等位基因变异数范围为2～11个,平均4.70个,多态性位点为139个,多态性位点比率是98.58％.UPGMA聚类分析发现,232份荔枝种质资源的遗传相似系数是0.66～1.00;发现SSR引物的多态性大于InDel引物;在遗传相似系数为0.76处,供试材料分为15类,多数来自海南的荔枝资源能一起聚类,海南11份野生荔枝资源分别聚类在5个类群中,说明海南野生荔枝资源的遗传多样性较丰富.研究将为进一步开展荔枝遗传改良和育种提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王家保		79	691	14.0	22.0
2	张蕾		17	133	6.0	11.0
3	张新春		19	68	5.0	6.0
4	李焕苓		20	53	4.0	6.0
5	田婉莹		7	19	2.0	4.0
6	孙进华		15	35	3.0	5.0
7	王树军		8	8	2.0	2.0
8	王果		11	16	2.0	3.0