家兔矮小同源盒基因(Shox2)的克隆和表达分析

• 作者: 朱子凤 杨晓农 陈瑞 黄坚
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 家兔 矮小同源盒基因(Shox2) 克隆 生物信息学分析 表达图谱
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 61-70
• 页数: 10页
• 分类号: S829.12
• 字数: 4192字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.01.008

摘要

为了研究新西兰白兔矮小同源盒基因(Shox2)序列,预测其结构和功能,以及研究Shox2基因的时空表达特征,本研究克隆了新西兰白兔Shox2基因全长CDS区,分析其编码蛋白的同源性、亲疏水性、二级和三级结构特点、系统进化树等生物信息学特征,并用Western blot法验证融合蛋白TrxA-Shox2.分别在胚胎中期(E20.5 d)、胚胎后期(E28.5 d)、幼龄期(出生后10 d)、成年期(A)4个时间点采集3只动物的肾、大血管、真皮、心、大脑、肝、肺、脾、肌肉、胆囊共10种组织,采用实时荧光定量PCR技术研究Shox2基因的时空表达图谱.结果,成功克隆了新西兰白兔Shox2基因(登录号:KP726285).Shox2基因CDS区全长666 bp,翻译221个氨基酸.生物信息学分析显示,Shox2为碱性、不稳定蛋白,Shox2蛋白氨基酸二级结构中α-螺旋区域占61.99％,无规则卷曲区域占33.48％,延伸链占4.52％.Western blot验证了融合蛋白TrxA-Shox2的表达.家兔Shox2蛋白氨基酸序列与眼镜猴、猩猩、褐家鼠、人的氨基酸序列同源性较高,说明Shox2蛋白在进化中较保守.Shox2基因mRNA在很多器官都有表达,在E20.5 d的家兔胚胎中,Shox2 mRNA在肾、肌肉和胆囊的表达量高,在E28.5 d时表达量较高的是脾、心,幼龄期时表达量较高的是真皮、肝,成年期时表达量较高的是真皮、脾.本研究成功克隆了新西兰白兔Shox2基因,预测了其结构和功能.Shox2基因mRNA在很多器官都有表达,不同的组织和不同时间特征的表达量变化可能与Shox2功能高度相关,并受到严格的调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨晓农	西南民族大学生命科学与技术学院	70	300	10.0	14.0
3	朱子凤		19	71	6.0	8.0
4	黄坚	西南民族大学生命科学与技术学院	16	11	2.0	3.0
6	陈瑞	西南民族大学生命科学与技术学院	5	21	2.0	4.0