非核糖体肽合成酶基因腺苷酰化结构域序列克隆及分析

• 作者: 张成锁 李根 薛永常
• 来源期刊: 微生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 非核糖体肽合成酶 腺苷酰化结构域 生物信息
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 20-25
• 页数: 6页
• 分类号: Q785
• 字数: 3945字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-7021.2019.01.003

摘要

微生物许多非核糖体肽类次生代谢产物主要是由非核糖体肽合成酶(NRPS)催化合成.参考Gon-tang发布的非核糖体肽合成酶(NRPS)通用引物设计扩增NRPS腺苷酰化结构域基因序列的特异引物,从海洋链霉菌L1的基因组DNA中扩增获得一个715 bp的NRPS基因序列.测序结果及比对分析表明该片段属于NRPS腺苷酰化结构域部分序列.对其拟翻译的氨基酸序列组成成分、理化性质进行分析,显示其包含AFD class I超基因家族核心结合区,为NRPS腺苷酰化结构域(A结构域)所在区域.对氨基酸序列的二级结构预测和三级结构模拟,发现与数据库中肠菌素合酶F组分的结构相似.为后续研究A结构域的特异性及完整NRPS基因簇克隆提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛永常	大连工业大学生物工程学院	59	364	10.0	17.0
2	李根	大连工业大学生物工程学院	7	8	2.0	2.0
3	张成锁	大连工业大学生物工程学院	1	1	1.0	1.0