SSR标记在毛木耳种质资源遗传多样性研究中的应用

• 作者: 姚方杰 孔祥会 张友民 方明 王鹏 鲁丽鑫 黄程远
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 聚类分析 遗传差异 子实体颜色 野生菌株 栽培菌株
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 2122-2132
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.190139

摘要

本研究利用基于毛木耳全基因组开发的SSR标记对27份毛木耳菌株(野生14株、栽培13株)的遗传多样性进行分析.首先随机选取3个菌株(2个野生菌株、1个栽培菌株)的DNA为模板,从144对SSR引物中筛选出扩增条带清晰、稳定性强、多态性丰富的引物24对.24对SSR引物共检测到116个多态性SSR片段,每对引物的多态性片段有3-7个,引物平均检测效率为4.83个,Shannon's遗传多样性指数范围是0.866-1.885,多态性位点比率100％.供试菌株遗传相似系数范围是0.618-0.971,说明毛木耳种质资源具有丰富的遗传多样性.野生菌株与栽培菌株间平均遗传相似系数分别为0.746、0.779,说明毛木耳野生菌株遗传多样性更为丰富.经聚类分析,在遗传相似系数为0.680时,可将供试菌株分为无色(白色)类群Ⅰ和有色(浅黄色到红褐色)类群Ⅱ.遗传相似系数为0.704时,可将供试菌株中栽培菌株和野生菌株明显区分(14株野生菌株均在类群Ⅱ-2中,13株栽培菌株分别在类群Ⅰ和Ⅱ-1中).本研究表明基于全基因组的SSR标记能从分子水平上揭示各菌株间的遗传差异,丰富毛木耳遗传多样性的研究手段,并为进一步进行毛木耳的品种选育、遗传学研究等提供有力手段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张友民	吉林农业大学园艺学院	69	484	12.0	19.0
2	姚方杰	吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心	86	752	13.0	24.0
6	方明	吉林农业大学园艺学院	21	107	6.0	9.0
7	王鹏	吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心	25	54	4.0	6.0
8	黄程远	吉林农业大学园艺学院	1	1	1.0	1.0
9	孔祥会	吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心	2	1	1.0	1.0
10	鲁丽鑫	吉林农业大学园艺学院	4	17	2.0	4.0