玉米大斑病菌StH-PDE和StL-PDE启动子预测及表达模式分析

• 作者: 张燕 李天聪 王建霞 王擎 申珅
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 玉米大斑病菌 StH-PDE StL-PDE 启动子 表达模式
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 页码范围: 15-20
• 页数: 6页
• 分类号: S432.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2019.0094

摘要

本研究利用生物信息学手段分析了玉米大斑病菌高亲和力cAMP磷酸二酯酶(High-affinity cAMPphosphodiesterase,H-PDE)和低亲和力cAMP磷酸二酯酶(Low-affinity cAMP phosphodiesterase,L-PDE)氨基酸序列同源性,发现StH-PDE与狂犬壳二胞菌(Ascochyta rabiei)、小麦黄斑叶枯病菌(Pyrenophora triticirepentis)、链格孢(Alternaria alternata)中同源蛋白的氨基酸序列相似性分别为69.21％、84.21％、85.94％,StL-PDE与狂犬壳二胞菌、壳球孢菌(Macrophomina phaseolina)、小麦黄斑叶枯病菌中同源蛋白的氨基酸序列相似性分别为57.90％,60.14％,71.38％;启动子预测发现,StH-PDE和StL-PDE启动子区存在SP1、AP1、p53、STAT5、AP-2、ATF/CREB以及GATA等转录因子结合位点.进一步利用实时荧光定量PCR技术检测其在不同碳源、氮源环境中的表达情况,结果表明,以果糖、乳糖、山梨醇和淀粉作为碳源对StH-PDE和StL-PDE的表达具有诱导作用,其中以山梨醇对StH-PDE表达影响最强,铵态氮和尿素作为氮源对StH-PDE和StL-PDE的表达有明显的诱导作用,而硝态氮诱导作用不明显.所以,明确PDE对碳氮源的响应为深入研究其基因功能奠定理论基础.