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摘要:
防御素(defensin)是最重要的抗菌肽(AMPs)之一,参与先天免疫防御反应.该研究通过RNA-seq和RACE技术从杂色鲍(Halitotis diversicolor)中克隆到一种新的防御素基因(命名为HdDef1).HdDef1 cDNA的开放阅读框(ORF)为201 bp,编码66个氨基酸,编码蛋白由18个氨基酸的信号肽和48个氨基酸的成熟肽组成.HdDef1的成熟肽具有AMPs的特征,如分子量较低、净正电荷(+1)、高疏水残基率(45%).同时,成熟肽的6个半胱氨酸以C-X16-C-X3-C-X9-C-X4-C-X1-C模式排列,并通过3个二硫键(C1-C4、C2-C5和C3-C6)稳定 α-螺旋/β-折叠基序(CSαβ).此外,通过与冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)防御素在三维结构上的相似性及其系统进化关系比对表明,HdDef1是节肢动物防御素家族的新成员.荧光定量PCR显示,HdDef1转录本在肠、头、鳃、肝胰腺、外套膜和足中均有表达,其中肝胰腺具有最高的表达水平.哈维弧菌(Vibrio harveyi)感染后,肝胰腺中HdDef1 mRNA被显著诱导表达.结果表明,HdDef1可能在杂色鲍抵抗病原的免疫防御反应中发挥重要作用,但其在蛋白水平的抗菌活性还需要进一步研究.
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文献信息
篇名 杂色鲍防御素HdDef1的分子特征和表达分析
来源期刊 南方水产科学 学科 农学
关键词 杂色鲍 HdDef1 基因克隆 组织分布 免疫应激
年,卷(期) 2019,(6) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 1-8
页数 8页 分类号 S917.4
字数 5531字 语种 中文
DOI 10.12131/20190045
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 姚托 中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室 2 1 1.0 1.0
2 卢洁 中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室 1 0 0.0 0.0
3 叶灵通 中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室 1 0 0.0 0.0
4 陈华生 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
杂色鲍
HdDef1
基因克隆
组织分布
免疫应激
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方水产科学
双月刊
2095-0780
44-1683/S
大16开
广州市新港西路231号
46-65
1963
chi
出版文献量(篇)
1477
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2
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