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宏基因组分析方法探究高精料日粮对奶牛瘤胃产甲烷菌的影响
宏基因组分析方法探究高精料日粮对奶牛瘤胃产甲烷菌的影响
作者:
孙福昱
施辉毕
杨亮
楚康康
熊本海
罗清尧
蒋林树
薛夫光
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
泌乳奶牛
高精料日粮
产甲烷菌
宏基因组
生物信息学
摘要:
[目的]本研究旨在探究高精料日粮对瘤胃产甲烷菌区系的影响. [方法] 利用宏基因组检测手段结合生物信息学分析方法, 测定高精料日粮和对照日粮处理下瘤胃产甲烷菌区系的变化. [结果] 高精料日粮显著降低奶牛日采食量和产奶量, 瘤胃pH以及瘤胃乙酸的含量 (P<0.05); 显著提高了瘤胃中丙酸以及氨态氮的含量 (P<0.05).通过分类学分析, 总共鉴定出4纲36属108种产甲烷菌约占瘤胃微生物总量的0.37%~0.47% .其中Methanobacteria为产甲烷菌的主要构成部分, 约占产甲烷菌总量的 50%~55% ,Methanobrevibacter为Methanobacteria的主要组成部分.Thermoplasmata在所有产甲烷菌中占据第二多的位置, 约占产甲烷菌总量的 31% .差异分析结果表明: 高精料日粮显著降低了产甲烷菌总量、Methanobacteria和Methanopyri的相对含量 (P <0.05), 而对Methanococci和Methanomicrobia作用不显著.相关分析结果表明: 瘤胃产甲烷菌相对丰度与瘤胃中丙酸含量、氨态氮含量呈负相关关系, 与瘤胃乙酸含量呈正相关关系. [结论] 高精料日粮降低瘤胃产甲烷菌的相对丰度, 但过多饲喂高精料日粮会降低瘤胃pH, 造成亚急性瘤胃酸中毒 (SARA).利用宏基因组方法更加准确全面的鉴定出瘤胃产甲烷菌的种类和数量, 使得对于产甲烷菌有了更加准确的认识, 同时对于降低甲烷排放, 促进奶牛生产具有重要的意义.
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篇名
宏基因组分析方法探究高精料日粮对奶牛瘤胃产甲烷菌的影响
来源期刊
农业大数据学报
学科
农学
关键词
泌乳奶牛
高精料日粮
产甲烷菌
宏基因组
生物信息学
年,卷(期)
2019,(1)
所属期刊栏目
应用研究
研究方向
页码范围
45-55
页数
11页
分类号
S8-05
字数
5212字
语种
中文
DOI
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杨亮
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罗清尧
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
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蒋林树
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熊本海
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
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楚康康
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薛夫光
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农业大数据学报
主办单位:
中国农业科学院农业信息研究所
出版周期:
季刊
ISSN:
2096-6369
CN:
10-1555/G2
开本:
16开
出版地:
北京市海淀区中关村南大街12号
邮发代号:
创刊时间:
2019
语种:
chi
出版文献量(篇)
101
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0
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65
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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