使用遗传算法优化登革热病毒信封蛋白的肽抑制剂

• 作者: 张松杰 徐永涛 杨敏 贺子豪 赵俊强
• 来源期刊: 河南师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 登革热病毒 膜融合 信封蛋白 肽抑制剂 遗传算法
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 数学
• 页码范围: 38-44
• 页数: 7页
• 分类号: R318.04
• 语种: 中文
• DOI: 10.16366/j.cnki.1000-2367.2019.06.006

摘要

登革热病毒严重威胁了人类的健康.目前仍无有效的治疗措施.膜融合是登革热病毒入侵细胞的第一步.信封蛋白的构象变化在膜融合过程中起到关键作用.研发针对信封蛋白的肽抑制剂为治疗登革热提供了潜在的重要靶点.设计了优化针对信封蛋白的肽抑制剂的遗传算法,分别使用3种不同的选择算子(轮盘法、锦标赛法和并行法).对初始父代进行300代的优化.通过比较发现并行法的结果较好,命名最优的结果为DN58ga.与此同时还获得了一些多肽衍生物.通过计算验证,这些多肽比父代表现出与登革热病毒信封蛋白更好的结合能力.这些新的肽抑制剂有可能打断融合过程中的蛋白-蛋白相互作用,并有望作为开发登革热病毒信封蛋白新型抑制剂的起点.